動植物防疫所呼籲本縣水稻正值秧苗期至分蘗期，雨後易造成疫病蟲害發生，尤其應注意防範紋枯病、白葉枯病、細菌性條斑病、穗稻熱病及螟蟲類等疫病蟲害發生。
台南區改良場表示大雨過後農作物易發生病害，田間宜儘速排水，加強通風，降低濕度，雨後出現的罹病植株應儘速清除以降低病原菌密度，再配合施藥防治，才能有效控制病害之蔓延。
台南區改良場表示稻作田區出現「死心」、「倒心」等螟蟲危害徵狀，應掌握初期防除工作，在田間葉鞘黃化達 10 ％至 15 ％以上時應立即施藥。後期防治則須掌握成蛾的發生，在田間成蛾密度達到每平方公尺一隻時為發生盛期，於其後7～10天施藥防治，可得到最好的防治效果。農友可選用二化螟蟲登記藥劑同時防治，如 50％芬殺松乳劑 1000倍或 50％撲滅松乳劑 1000倍或 22.5％陶斯松乳劑 450倍等，亦可於分蘗期及孕穗末期施用 9％培丹粒劑或 0.3％芬普尼粒劑進行預防。
農作物疫病蟲害防治藥劑可參考行政院農業委員會動植物防疫檢疫局-農藥資訊服務網-登記管理-病蟲害防治(網址：https://pesticide.baphiq.gov.tw/web/Insecticides_MenuItem5_5.aspx)，用藥時應依標示使用，並嚴格遵守安全採收期。